十方普觉寺始建于唐贞观年间（627—649），距今已有1300余年的历史，初名“兜率寺”。元代至治元年（1321）英宗时铸造铜质实心释迦牟尼卧佛像，长5.3米，高1.6米，重约54吨，为稀世之宝。
清雍正年间，怡亲王允祥出资修缮，雍正十二年（1734）竣工，雍正皇帝钦赐寺名“十方普觉寺”，并作碑文。曹家与怡亲王府关系甚密。曹雪芹居正白旗时，友人称他“寻诗人去留僧舍”，知其常流连于香山一带寺庙内。
乾隆四十八年（1783），清政府对寺庙进行大修，形成了如今寺庙的格局。其古柏夹道、娑罗树、元代铜铸卧佛等为历来游览者所称道，为中国十大名寺之一。

樱桃沟，系太行山第八陉，因溪谷中自然生长有大量毛樱桃而得名。据文献记载，自金代起，该处即为北京有名的游览胜地。
清顺治十一年（1654），由清吏部左侍郎任上退职的孙承泽隐居于此，因孙自号“退翁”，故名此谷为“退谷”，并作《退谷小志》。
樱桃沟因得天独厚的地貌、泉水、植被为历代文人所称道，其中既有名列“宛平新八景”之一的“退谷水源”（水源头）和元宝石、石上松等自然景观，也有清初孙承泽别墅、民国周肇祥花园及历代寺庙遗址等人文景观。
曹雪芹在正白旗居住时，经常散步至樱桃沟，也经常经樱桃沟翻山至白家疃。樱桃沟的山水滋润了曹雪芹的生活与思想，并影响了其《红楼梦》的创作。
中国特有的第四纪冰川孑遗植物水杉就被保育在樱桃沟。目前，已经长成为北方最大的水杉林。

曹雪芹纪念馆是中国最早建立的、也是目前规模最大的以曹雪芹、《红楼梦》为主题的历史文化名人纪念馆。
纪念馆以发现“题壁诗”的正白旗39号院为基础，修缮、复建部分建筑，系统地展示有关曹雪芹、《红楼梦》的历史、文化与艺术。纪念馆创建于1984年，历经四次扩建、七次布展。三十年多来，共接待国内外游客千万人次，为中华优秀传统文化的传播做出了贡献。

“一二·九”运动纪念亭于1985年12月9日落成，由北京工业大学建筑系师生设计。纪念亭由3座三棱锥体小亭组成，主亭高5.5米，次亭高4.2米，边长1.8米。三角形的造型象征着当时军事夏令营的露营帐篷，3个亭子组成了立体的“众”字，象征着中华民族众志成城、抵抗侵略的决心。北侧山坡东侧是彭真同志的题字，西侧是刘炳森先生书写的碑文，记述了一二·九运动的光荣历史和建造纪念亭的深远意义。

香山地区，山青水碧，风景秀丽，是达官显贵和各界名人欲求的风水宝地，因此名人墓园众多，有瑞王坟、礼王坟、公主坟等。 植物园范围内也有不少名人墓园，如孙传芳墓、梁启超墓、王锡彤墓、张绍曾墓、高仁山墓、冒鹤亭墓等。葬于此的名人均在中国的历史上产生过一定的影响，这些历史遗迹和名人墓园是了解历史最为直观的教材，有着特殊的价值。

这是一座方座螭首，由康熙御笔所题的石碑。碑高3.30米、宽1.00米、厚0.32米，碑座高0.80米、宽1.27米、厚0.72米。

碑额刻篆：“钦赐御书”
碑身刻康熙皇帝五律一首：《赋得芳气有无中》
“大儒吟咏物，正自托诗情。气质原含内，芬芳远向荣。藕花中外直，绛雪有无名。惟愿菊兰气，山林勿使轻。”

此诗收录在圣祖仁皇帝御制文集第三集卷四十五古今体诗25首中。

据植物园多位老先生回忆，此碑在上世纪五十年代建园之初即被发现于园东南角（现葡萄地）。因难以准确识别其碑文及具体年代，故一直藏于园内至今。在第三次全国文物普查时此碑被列入文物普查登记项目，在海淀区文保部门登记为“乾隆碑”。近期经仔细辨认和查证，此碑确为康熙御笔所题。鉴于此诗为康熙皇帝赏藕花（荷）而赋，植物园将诗碑立于园中央荷花池边，加以重点保护并供广大游人参观。

菩提树（Ficus religiosa L.）
桑科榕属植物，与佛教有着紧密的联系。植物园的这株菩提树是20世纪50年代印度总理尼赫鲁送给毛主席和周总理的国礼植物，其源自当年佛祖坐禅的那株菩提树。现种植于展览温室内。

樱花（Cerasus sp.）
蔷薇科樱属植物，是世人皆知的美丽花木，也是日本的国花。植物园种植的这些樱花除了有美丽多姿的外表，更是中日友谊的象征。20世纪随着我国与日本交流的增多，最终实现了中日邦交正常化，为此，日本前首相田中角荣1976年赠送了我国100 株樱花（Cerasus sp.）和唐松（Larix sp.）。其中部分种植在珍稀濒危植物区，40多年了依然枝繁叶茂、花团锦簇。

此外，还有阿尔巴尼亚主席谢胡赠送周总理的油橄榄（Olea europaea Linn.），越南胡志明主席及越南使馆分别赠送的九重葛（Bougainvillea brasiliensis Raeusch.）、凤梨（Guzmania sp.）等，现种植于展览温室内。